学校の環境衛生については、学校保健安全法第6条第1項の規定に基づき、「学校環境衛生基準」（平成21年文部科学省告示第60号）が平成21年3月31日に公布され、平成21年4月1日から施行されました。現行の基準は、平成30年3月30日に基準を一部改正する告示が公布され、同4月1日から施行されています。
また、学校給食における衛生管理の徹底については、学校給食法第9条第1項の規定に基づき、「学校給食衛生管理基準」（平成21年文部科学省告示第64号）が平成21年3月31日に公布され、平成21年4月1日から施行されました。
学校の設置者は、これらの基準に照らして適切な環境の維持に努めなければならないとされています。